【中(zhōng)心實驗室介紹】
中(zhōng)心實驗室是江西省兒童醫(yī)學(xué)研究所重要的組成部分(fēn),于2012年10月正式組建并對全院開放。目前承擔的科(kē)研課題有(yǒu)國(guó)家自然科(kē)學(xué)基金項目、省科(kē)技(jì )廳重大科(kē)研項目、省自然科(kē)學(xué)基金項目和省衛計委科(kē)研項目數十項等。
實驗室主要目标是以轉化醫(yī)學(xué)為(wèi)核心,積極與臨床科(kē)室密切合作(zuò),實現“臨床-實驗室-臨床”的良性循環,臨床問題拿(ná)到實驗室解決,實驗結果再放到臨床驗證,從而使科(kē)研成果真正的轉化為(wèi)生産(chǎn)力。
【中(zhōng)心實驗室主要工(gōng)作(zuò)内容】
1. 科(kē)研服務(wù):加強實驗室技(jì )術平台的建設和管理(lǐ),為(wèi)全院廣大醫(yī)務(wù)科(kē)技(jì )人員及研究生提供實驗場地和儀器設備,以及實驗技(jì )術和實驗方法的指導和建議,協助課題組完成相關的基礎研究工(gōng)作(zuò)和研究生的培訓工(gōng)作(zuò)。近年來,在此平台上開展的科(kē)研項目包括9項國(guó)家自然科(kē)學(xué)基金以及多(duō)項省科(kē)技(jì )廳、衛計委課題,指導多(duō)名(míng)碩士和博士研究生。
2. 建立臨床-科(kē)研協作(zuò)新(xīn)模式:實驗室與醫(yī)院臨床科(kē)室密切合作(zuò),搭建臨床-基礎研究平台,實行“雙PI制度”。采取科(kē)研人員定期參與臨床查房、臨床醫(yī)生定期培訓、相互參加彼此的病例讨論會和實驗讨論會等多(duō)種方式,積極溝通,共同探讨臨床的疑難問題及科(kē)研最新(xīn)動态,真正做到臨床與科(kē)研的零距離交流及協作(zuò)。研究人員與臨床醫(yī)生合作(zuò)開展相關科(kē)研項目及建立科(kē)研平台,開展日常臨床樣本的收集管理(lǐ)、基礎研究工(gōng)作(zuò)以及研究生的培訓工(gōng)作(zuò)。
3. 建立和完善生物(wù)樣本庫:樣本庫存儲的内容包括:一是實體(tǐ)樣本庫,即可(kě)以從中(zhōng)提取到 DNA、RNA、蛋白質(zhì)等成分(fēn)的組織或血液等生物(wù)樣本;二是樣本信息庫,包括從生物(wù)樣本中(zhōng)提取 DNA、RNA、蛋白質(zhì)等成分(fēn)所得到的個人獨有(yǒu)的遺傳信息數據及臨床診療信息。2016年,我們成為(wèi)“中(zhōng)國(guó)醫(yī)藥生物(wù)技(jì )術協會組織生物(wù)樣本庫分(fēn)會兒科(kē)學(xué)組”委員單位。
4. 提供兒童精(jīng)準診斷服務(wù):我們與複旦大學(xué)附屬兒科(kē)醫(yī)院合作(zuò),共建兒童精(jīng)準醫(yī)學(xué)聯合實驗室,将疾病診斷拓展到基因水平,對于已有(yǒu)明确治療方法的遺傳病,可(kě)以盡早診斷并指導臨床進行早期治療,有(yǒu)效降低傷殘率和死亡率;對于尚無治療方法的遺傳性疾病和可(kě)能(néng)出現的并發症進行規範化治療,改善預後。
【兒研所實驗技(jì )術平台】
(一)醫(yī)學(xué)分(fēn)子診斷和基因組研究平台
我所目前開展的基因診斷項目有(yǒu)新(xīn)生兒常見遺傳性疾病基因檢測(複旦大學(xué)兒科(kē)精(jīng)準聯合實驗室)、白血病融合基因檢測、SRY性别基因和Y染色體(tǐ)微缺失檢測等。
通過基因檢測,在血液腫瘤、免疫、遺傳代謝(xiè)疾病等較多(duō)領域指導臨床醫(yī)師制定精(jīng)準的診療方案。如:指導醫(yī)師制定分(fēn)層的白血病治療方案及監測病情進展。協助臨床基因确診肝豆核變性、Schaaf-Yang綜合征、Citrin缺乏、異丁酰輔酶A脫氫酶缺乏症、球形紅細胞增多(duō)症2型、磷酸吡哆醇氧化酶缺乏症、原發性肉堿缺乏症、丙酸血症、Bannayan-Riley-Ruvalcab征、先天性純紅細胞再障6型、甲狀腺分(fēn)泌功能(néng)障礙6型、先天性中(zhōng)樞性低通氣綜合征、局竈性皮膚發育不全例、急性骨化性纖維發育不良、TARP綜合征、Dent病2型、類脂性腎上腺增生症、糖原累積症III型、糖原累積症Ia型、小(xiǎo)胖威力綜合征等疾病。
(二)小(xiǎo)兒先天畸形疾病研究平台
小(xiǎo)兒先天性畸形研究平台以中(zhōng)心實驗室、新(xīn)生兒外科(kē)、小(xiǎo)兒心髒病治療中(zhōng)心等科(kē)室共同協作(zuò)組成,開展小(xiǎo)兒先天畸形(如膽管閉鎖、食管閉鎖、巨結腸、無肛、法四、室缺、房缺、唇腭裂等)疾病臨床轉化與精(jīng)準診療研究,以确立相應疾病的診斷标準、提供治療方案為(wèi)主要目标。該平台已獲得國(guó)家基金委項目3項、省科(kē)技(jì )進步獎一等獎1項、三等獎1項。
(三) 兒童白血病分(fēn)子診斷平台
兒童白血病分(fēn)子診斷平台由中(zhōng)心實驗室、血液科(kē)、病理(lǐ)科(kē)、檢驗科(kē)等共同協助組成,将數字PCR、二代測序、MLPA、Sanger測序等分(fēn)子檢測技(jì )術引入白血病診斷體(tǐ)系中(zhōng),将檢測内容從染色體(tǐ)數目結構異常、融合基因定量逐步拓展到拷貝數變異、基因突變以及表觀遺傳學(xué)改變上,在國(guó)内率先建立了符合兒童流行病學(xué)和遺傳學(xué)特點的分(fēn)子診斷體(tǐ)系,在白血病精(jīng)細化診斷分(fēn)層和預後預測、分(fēn)子靶向藥物(wù)篩選、疾病動态監測和個體(tǐ)化治療開展以及預測疾病早期複發上指導着臨床工(gōng)作(zuò)。每年約400多(duō)名(míng)患者從中(zhōng)受益。
在白血病病情監測方面,建立了基于數字PCR技(jì )術和熒光定量PCR技(jì )術的微小(xiǎo)殘留病(MRD)的分(fēn)子篩選和監控體(tǐ)系,建立了涵蓋初診、誘導治療第19天,鞏固治療第46天、維持治療期間以及結束治療時的5個時間點的檢測流程,指導臨床根據相應時間點的微量殘留病水平進行治療方案調整,從而為(wèi)兒童白血病精(jīng)準治療的實施奠定了基礎,有(yǒu)力地配合了我省“白血病免費救治”的民(mín)生工(gōng)程,推動了全省兒童白血病精(jīng)準診療的發展。該平台已獲得國(guó)家基金委項目2項、省科(kē)技(jì )廳重點項目1項等。
(四)江西省兒童遺傳代謝(xiè)病平台
江西省兒童遺傳代謝(xiè)篩查平台是由中(zhōng)心實驗室、内分(fēn)泌遺傳代謝(xiè)科(kē)及全院多(duō)個科(kē)室協作(zuò)組成,為(wèi)江西省最早進行兒童串聯質(zhì)譜及氣相色譜檢測的單位。平台配有(yǒu)LC-MS、GC-MS兩套先進的高通量生化分(fēn)析設備,進行血串聯質(zhì)譜及尿氣相色譜檢測,可(kě)篩查和診斷包括氨基酸代謝(xiè)障礙、有(yǒu)機酸代謝(xiè)障礙、脂肪酸代謝(xiè)障礙等約40餘種遺傳代謝(xiè)病。
目前年篩查樣本量,血串聯質(zhì)譜約為(wèi)7500例、尿氣相色譜約為(wèi)2500例,并逐年上升,篩查陽性患者并經基因确診的遺傳代謝(xiè)病有(yǒu):原發性肉堿缺乏症、鳥氨酸氨甲酰轉移酶(OTC)缺乏症、精(jīng)氨基琥珀酸尿症、3-甲基巴豆酰輔酶A羧化酶缺乏症1型、尿黑酸尿症、丙酸血症、β酮硫解酶缺乏症、希特林蛋白缺乏症、異戊酸血症、甲基丙二酸血症、苯丙酮尿症、異丁酰輔酶A脫氫酶缺乏症、線(xiàn)粒體(tǐ)病等,為(wèi)江西省遺傳代謝(xiè)病危重症患者快速診斷及治療提供了強有(yǒu)力的技(jì )術支持。該平台目前已獲得國(guó)家基金委項目1項、省科(kē)技(jì )廳重點項目1項、省科(kē)技(jì )進步獎三等獎2項等。
(五)兒童免疫系統疾病研究平台
兒童免疫系統疾病研究平台以中(zhōng)心實驗室、免疫科(kē)、感染科(kē)等科(kē)室共同協作(zuò)組成,開展免疫系統疾病(如缺氧胸腺損傷、免疫缺陷疾病與腫瘤免疫等)疾病臨床轉化與精(jīng)準診療研究,以确立相應免疫(腫瘤)疾病的診斷标準、提供治療方案及提高兒童免疫水平為(wèi)目标。
在已建立的“淋巴細胞計數”項目的研究基礎上,計劃開展“重症聯合免疫缺陷(SCID)篩查”、“基因測序”等臨床研究項目。該平台已獲得國(guó)家基金委項目1項,計劃設立“兒童缺氧胸腺損傷機制研究”、“免疫缺陷疾病發病機制研究”、“腫瘤免疫逃逸機制研究”等研究方向。
(六)生物(wù)樣本庫
目前設立規範信息化管理(lǐ)的生物(wù)樣本庫,配有(yǒu)-80℃超低溫冰箱、-40℃低溫冰箱、液氮罐、專業樣本庫管理(lǐ)軟件等設備。截止2020年4月,标本庫存儲的病種類型共有(yǒu)27種,約2萬餘份樣本,種類以專科(kē)疾病、罕見病、腫瘤、遺傳及代謝(xiè)性疾病為(wèi)主,包括:先天性結構畸形(先天性膽道閉鎖、先天性心髒病等)、兒童腫瘤(白血病、實體(tǐ)瘤等)、内分(fēn)泌遺傳代謝(xiè)病(矮小(xiǎo)症、糖尿病、代謝(xiè)病等)、免疫性疾病等組織、RNA、DNA樣本。
【主要開展的技(jì )術項目】
1. DNA/RNA提取及定量 | 2.體(tǐ)外逆轉錄反應 |
3.核酸擴增及定量擴增 | 4.載體(tǐ)構建及鑒定 |
5.基因克隆、轉染及表達 | 6.蛋白提取、純化及濃度測定 |
7.Western blot | 8.凝膠成像 |
9.核酸雜交 | 10.體(tǐ)外GST-pull down |
11.體(tǐ)内Co-IP實驗 | 12.染色質(zhì)免疫共沉澱 |
13.報告基因檢測 | 14.細菌轉化 |
15.免疫組化 | 16.熒光原位雜交 |
17.組織細胞培養 | 18.細胞轉染 |
19.熒光顯微鏡成像及分(fēn)析 | 20.細胞周期、凋亡 |
21.标本-80℃保存 | 22.細胞液氮凍存 |
23.超純水、雙蒸水的制備 | 24.低溫高速離心 |
25.高壓消毒滅菌 | 26.白血病融合基因檢測 |
27.血、尿代謝(xiè)産(chǎn)物(wù)檢測 | 28.SRY基因、Y缺失基因檢測 |
29.白血病分(fēn)型診斷和危險度分(fēn)層 | 30.先天性遺傳代謝(xiè)病分(fēn)子診斷 |
【主要儀器設備】
細胞培養全套設備、熒光定量PCR儀、數字PCR儀、微量核酸蛋白檢測儀、梯度PCR儀、常/低溫高速離心機、蛋白電(diàn)泳轉膜系統、核酸電(diàn)泳系統 、凝膠成像系統、化學(xué)發光成像分(fēn)析系統、細胞電(diàn)穿孔儀、正/倒置熒光顯微鏡、Bioruptor非接觸式全自動超聲破碎儀、-80℃低溫冰箱、液氮罐、全自動高壓滅菌消毒鍋、Millipore純水系統、高效液相色譜儀、氣相色譜儀、流式細胞儀、多(duō)功能(néng)酶标儀等。實驗室實行儀器設備共享,已加入江西省大型科(kē)研儀器網絡管理(lǐ)平台,儀器設備在線(xiàn)共享。
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